| 課程名稱 | 每學期學分 | 應修學期數 | 總學分數 | 說明 | ||
| 共同必修課程 | 博士班專題研究一 | 1 | 1 | 1 | ||
| 博士班專題研究二 | 1 | 1 | 1 | |||
| 專題書報討論 | 1 | 4 | 4 | |||
| 專題演講 | 0 | 4 | 0 | 2學年內，修至畢業學期為止。 | ||
| 論文研究 | 0 | 1 | 0 | 不列入畢業學分 | ||
| 研究倫理教育課程 | 0 | 1 | 0 | 本課程採網路教學方式實施，須於入學第一學年結束前修習完畢。 | ||
| 共同必修課程應修學分數 | 6 | |||||
| 核心必修課程 (必選二科) 4選2 |
環境化學 | 3 | 1 | 3 | ||
| 環境分析化學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 綠色科技 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境生物技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 核心必修課程應修學分數 | 6 | |||||
| 選修課程 | 分析化學領域 | 微量分析 | 3 | 1 | 3 | |
| 食品安全與衛生技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 生物分析技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 分子光譜學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 空氣品質量測 | 3 | 1 | 3 | |||
| 空氣懸浮微粒特性分析 | 3 | 1 | 3 | |||
| 表面分析技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境微生物檢驗分析技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 生態與健康領域 | 生物環境復育 | 3 | 1 | 3 | ||
| 環境感測器的研發與應用 | 3 | 1 | 3 | |||
| 污染生態學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 當代環境醫學特論(I) | 1 | 1 | 1 | |||
| 當代環境醫學特論(II) | 1 | 1 | 1 | |||
| 環境新興污染物 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境微生物學應用 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境品質與生物指標 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境毒物學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 綠色科技領域 | 廢棄物與處理 | 3 | 1 | 3 | ||
| 環境奈米科學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 奈米材料環境應用 | 3 | 1 | 3 | |||
| 觸媒技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境分子科學 | 3 | 1 | 3 | |||
| 綠色分析技術 | 3 | 1 | 3 | |||
| 環境奈米與水處理 | 3 | 1 | 3 | |||
| 選修課程應修學分數 | 6 | |||||
| 應修畢業學分數 | 18 | |||||